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◉ Qu'est-ce que Staphylococcus saprophyticus?
Staphylococcus saprophyticus est une bactérie qui fait partie de la flore normale, colonisant des zones telles que le tractus génital, le rectum et le tractus gastro-intestinal chez les humains et les animaux.< /p>
S. saprophyticus se caractérise par sa capacité à adhérer à l'urothélium humain, ce qui en fait une cause fréquente d'infections des voies urinaires, en particulier chez les jeunes femmes sexuellement actives.
Les bandelettes de test urinaire peuvent donner un résultat faussement négatif dans le cas de S. saprophyticus (en raison de l'absence de formation de nitrites) et le traitement par la fosfomycine est souvent inefficace.
Le traitement de l'infection à Staphylococcus saprophyticus implique la culture d'un échantillon donné, l'identification de la bactérie et la réalisation d'un antibiogramme pour déterminer l'antibiotique le plus efficace.
Staphylococcus saprophyticus sur milieu de culture (1- chromogénique, 2- gélose au sang).
◉ Classification et nomenclature
Le nom Staphylococcus saprophyticus a été proposé pour la première fois par Shaw et al. en 1951, sur la base de l'isolement de cette bactérie à partir d'échantillons d'urine humaine.
- Le nom du genre est « Staphylococcus », ce qui signifie « amas de cocci en forme de raisin » en grec.
- Le nom de l'espèce est « Saprophyticus », ce qui signifie « vivant de matière en décomposition » en latin.
La classification des différentes espèces au sein du genre Staphylocoques est basée sur divers facteurs, notamment la morphologie, les propriétés chimiques, les séquences d'acides aminés, les caractéristiques biochimiques et les séquences de nucléotides.
- Domaine : Bactéries.
- Embranchement : Firmicutes.
- Classe : Bacilles.
- Ordre : Bacillales.
- Famille : Staphylococcaceae.
- Genre : Staphylococcus.
- Espèce : Staphylococcus saprophyticus.
- Sous-espèce : Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophytique
- Sous-espèce : Staphylococcus saprophyticus subsp. Bovis
◉ Manifestations cliniques
Staphylococcus saprophyticus est l'une des principales causes d'infections urinaires non compliquées chez les jeunes femmes sexuellement actives et plus rarement chez les hommes jeunes ou les personnes âgées.
- Cystite : elle peut provoquer une sensation de brûlure pendant la miction, des envies fréquentes d'uriner, du sang dans les urines, des douleurs abdominales basses et de la fièvre.
- Pyélonéphrite : moins fréquemment, elle peut provoquer des douleurs au flanc, des nausées, des vomissements et des frissons.
- Chez les hommes, S. saprophyticus peut entraîner une urétrite, une épididymite et une prostatite.
- Risque possible de formation de calculs dans les voies urinaires et d'épisodes de coliques néphrétiques.
S. saprophyticus a été associé à des cas de péritonite au cours de dialyse péritonéale, d'endocardite sur valvules natives et de pneumonie nosocomiale.
◉ Identification and Bacteriological Characteristics
Staphylococcus saprophyticus peut être identifié par ses caractéristiques culturelles, biochimiques et moléculaires. Les deux principales caractéristiques facilitant son identification sont, d'une part, qu'il appartient aux Staphylocoques à coagulase négative, et d'autre part, qu'il présente une résistance intrinsèque à la novobiocine.
Certaines des méthodes utilisées pour l'identification incluent:
◉ 1- Examen direct
Staphylococcus saprophyticus est un cocci Gram positif, non mobile, non sporulé, généralement non encapsulé, d'un diamètre moyen de 0,8 à 1,2 µm. Il peut apparaître sous forme de petites cellules rondes et isolées, ou sous forme de diplocoques, ou encore en amas irréguliers.
◉ 2- Culture
Comme tous les Staphylocoques, la culture de Staphylococcus saprophyticus ne pose généralement aucun problème, car elle ne présente pas d'exigences nutritionnelles particulières. Il peut être cultivé en atmosphère aérobie-anaérobie facultative, sur milieux chromogènes simples enrichis, ou sur gélose sélective pour les staphylocoques.
L'apparence des colonies peut varier d'un milieu de culture à l'autre ; généralement, les colonies apparaissent rondes, convexes, opaques, blanches et quelque peu crémeuses après 18 heures à 37°C, avec un diamètre de 2 à 3 mm.
- Gélose au sang : colonies non hémolytiques d'un blanc brillant crémeux.
- Gélose Chapman: Staphylococcus saprophyticus pousse dans cette gélose hautement salée. milieu par fermentation du mannitol, ce qui donne des colonies jaunes.
- Milieu chromogène: Staphylococcus saprophyticus présente une couleur distinctive, qui dépend de la marque spécifique de gélose utilisée.
◉ 3- Identification du genre Staphylococcus
Le genre Staphylococcus comprend des bactéries cocci à Gram positif, catalase positive et oxydase négative, et non exigeantes. Ces caractéristiques permettent de se différencier des bactéries des genres Streptococcus, Enterococcus et Micrococcus.
Pour plus d'informations sur l'identification du genre Staphylococcus, veuillez consulter notre lien : Comment identifier le genre Staphylococcus.
◉ 4- Identification de l'espèce Staphylococcus saprophyticus et caractérisation biochimique
Identifier l'espèce Staphylococcus saprophyticus et la différencier des autres espèces est essentielle, notamment en cas d'infections urinaires.
Staphylococcus saprophyticus appartient au groupe des Staphylococcus à coagulase négative. C'est pourquoi le premier test à réaliser vise à éliminer Staphylococcus aureus, comme le test de la coagulase, le test de la DNase ou le test d'agglutination.
- Mobilité : généralement immobile.
- Test DNAse : Négatif (-).
- Test de la coagulase : Négatif (-).
- Test catalase : Positif (+).
- Test oxydase : Négatif (-).
- Nitrate réductase : négatif (-).
- Phosphatase alcaline : négatif (-).
- PyrA : négatif (-).
- Arginine dihydrolase (ADH) : positif (+).
- Ornithine Décarboxylase (ODC) : Négatif (-).
- Test Voges-Proskauer (VP) : Positif (+).
- Utilisation du sorbose : négatif (-).
- Test d'uréase : Positif (+).
- Test au maltose : positif (+).
- Test lactose : positif (+).
- Test au tréhalose : positif (+).
- Test au mannitol : positif (+).
- Test au saccharose : positif (+).
Pour une identification biochimique plus complète, des galeries biochimiques telles que Api staph ou des automates d'identification bactériologique (MicroScan WalkAway plus System, ALFRED 60/AST.. ) peuvent être utilisées.
◉ 5- Profil de résistance aux antibiotiques
S. saprophyticus possède une résistance intrinsèque à la novobiocine et à la fosfomycine, ce qui peut aider à le détecter chez d'autres espèces.
◉ 6- Diagnostic moléculaire
PCR (réaction en chaîne par polymérase)
La PCR peut être utilisée pour identifier S. saprophyticus en ciblant son gène d'ARNr 16S. Ce gène possède une séquence unique qui peut être distinguée des autres staphylocoques grâce à l'utilisation d'amorces spécifiques.
RFLP (restriction fragment length polymorphism)
Le RFLP peut être utilisé pour identifier S. saprophyticus en utilisant une enzyme de restriction qui coupe le S. saprophyticus en un motif distinctif de fragments. Ces fragments peuvent être séparés par électrophorèse sur gel et comparés à ceux d'autres staphylocoques.
◉ Résistance
Staphylococcus saprophyticus est naturellement résistant à l'acide nalidixique, à la fosfomycine, à la novobiocine en raison d'une mutation dans la sous-unité GyrB de l'ADN gyrase, et à l'acide fusidique en raison de la présence du gène chromosomique fusD, codant pour un protéine qui protège le facteur d'élongation G.
◉ Conclusion
En conclusion, Staphylococcus saprophyticus pose un problème de santé important, en particulier chez les jeunes femmes souffrant d'infections des voies urinaires. En améliorant notre compréhension de cette bactérie et en mettant en œuvre des mesures préventives, nous pouvons nous efforcer de réduire le fardeau des infections à Staphylococcus saprophyticus et d'améliorer les résultats pour les patients.