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◉ Introduction
Enterococcus faecalis est un type de bactérie qui vit normalement dans le tractus gastro-intestinal humain en tant que flore normale, et peut également être trouvé dans la cavité buccale et le tractus vaginal, mais peut causer des infections dans d'autres parties du corps, surtout dans les milieux hospitaliers.
Certaines des infections courantes causées par E. faecalis sont les infections des voies urinaires, les infections de plaies, les infections sanguines et l'inflammation du cœur.
Pour diagnostiquer une infection à E. faecalis, un échantillon d'urine, de sang ou d'un autre fluide est prélevé et mis en culture pour identifier la bactérie et sa sensibilité aux antibiotiques.
◉ Classification et nomenclature
Enterococcus faecalis appartient au genre Enterococcus, à la famille des Enterococcaceae, à l'ordre des Lactobacillales et à la classe des Bacilli.
- Le nom Enterococcus signifie coccique intestinale, reflétant leur habitat commun.
- Il est appelé "faecalis" car il a été isolé pour la première fois à partir d'échantillons fécaux humains.
E. faecalis a été isolé et identifié pour la première fois en 1899 par le microbiologiste allemand Fritz Schmalz. Il a été initialement classé comme Streptococcus faecalis en raison de ses similitudes avec d'autres streptocoques.
En 1984, sur la base des caractéristiques biochimiques, génétiques et de la paroi cellulaire, le Comité international de systématique des procaryotes a proposé de reclasser le groupe Streptococcus faecalis dans un genre distinct, Enterococcus.
◉ Épidémiologie
Les entérocoques sont couramment présents dans le tractus digestif humain et animal, colonisant souvent la peau et les voies génito-urinaires. Enterococcus faecalis est l'espèce prédominante du genre, constituant 80 à 90 % des isolats cliniques.
Ces bactéries sont opportunistes et ubiquitaires, capables de survivre pendant plusieurs semaines dans l'environnement hospitalier, en particulier sur les surfaces et le linge contaminés.
Bien qu'elles soient relativement pauvres en facteurs de virulence par rapport à d'autres bactéries, l'accumulation de mécanismes de résistance et l'augmentation croissante de leur isolement, en particulier dans les infections nosocomiales, ont suscité un regain d'intérêt pour ce genre bactérien.
Les infections à Enterococcus faecalis sont plus fréquentes chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli, celles souffrant de maladies chroniques, de cancer, de transplantations d'organes ou de procédures invasives. Les personnes âgées, les nourrissons et les femmes enceintes sont également plus sensibles aux infections à E. faecalis.
La transmission des enterocoques faecalis se fait par contact direct, via les surfaces (pouvant survivre jusqu'à 4 mois sur des surfaces sèches), ainsi que par l'eau et les aliments contaminés.
◉ Manifestations cliniques
Les symptômes d'une infection à Enterococcus faecalis dépendent de l'emplacement et de la gravité de l'infection, ainsi que du statut immunitaire de la personne et de son état de santé sous-jacent.
Certaines des manifestations cliniques courantes de E. faecalis les infections sont:
◉ 1- Infections des voies urinaires (IVU)
L'infection urinaire par Enterococcus faecalis est plus fréquente en milieu hospitalier, en particulier si le patient est un homme, s'il est sondé ou s'il a reçu une antibiothérapie à large spectre.
L'infection peut être mono-bactérienne ou associée à d'autres germes (bactéries à Gram négatif), provoquant soit une colonisation, soit une bactériurie asymptomatique, soit des infections urinaires typiques (douleurs, brûlures à la miction, polyurie, urines troubles ou sanglantes, etc.).
◉ 2- Endocardite
Il s'agit d'une infection de la paroi interne du cœur ou des valvules cardiaques. Enterococcus faecalis peut provoquer une endocardite en pénétrant dans la circulation sanguine par le tube digestif ou génito-urinaire, lors d'interventions dentaires, de la consommation de drogues intraveineuses ou par d'autres moyens.
L'endocardite est plus fréquente à mesure que le patient vieillit ou s'il existe une maladie cardiaque préexistante. Cela peut provoquer de la fièvre, des frissons, de la fatigue, des douleurs thoraciques, un essoufflement et un souffle cardiaque.
◉ 3- Bactériémie
Enterococcus faecalis peut provoquer une bactériémie en contaminant un cathéter, un port de dialyse ou en se propageant à partir d'un site urinaire, biliaire, intra-abdominal ou superficiel (la peau d'une brûlure victime).
Les bactériémies sont souvent nosocomiales avec un pronostic sévère, elles peuvent provoquer de la fièvre, des frissons, de la fatigue, des maux de tête, une respiration rapide et une hypotension artérielle, voire la mort.
◉ 4- Infections des plaies
Ils surviennent généralement à la suite de la contamination d'une plaie, soit par contact direct avec la bactérie, soit par sa propagation à partir d'un autre site infecté par Enterococcus faecalis.. p>
Ces infections peuvent se manifester par des symptômes tels qu'une douleur localisée, un gonflement, une rougeur et un écoulement. Dans les cas plus graves, des symptômes systémiques comme de la fièvre, des frissons et de la fatigue peuvent également être présents.
◉ 5- Meningitis
E. faecalis peut provoquer une méningite en pénétrant dans la circulation sanguine par le biais d'un traumatisme crânien, d'une intervention chirurgicale ou d'autres moyens. La méningite peut provoquer de la fièvre, des maux de tête, une raideur de la nuque, une sensibilité à la lumière, de la confusion et des convulsions.
◉ Identification et caractères bactériologiques
Enterococcus faecalis peut être identifié par ses caractéristiques culturelles, biochimiques et moléculaires. Certaines des méthodes utilisées pour l'identification comprennent:
◉ 1- Examen direct
Au microscope et après coloration de Gram, Enterococcus faecalis apparaît sous la forme de coques Gram-positives ovales ou rondes regroupées par paires ou en chaînes courtes.
◉ 2- Culture
Enterococcus faecalis se développe facilement sur des milieux de culture courants dans des conditions atmosphériques normales, généralement dans les 18 à 24 heures, à des températures allant de 10 à 45°C.
E. faecalis produit de petites colonies (colonies ponctuelles), d'apparence lisse, grise ou gris blanchâtre, présentant des caractéristiques non hémolytiques (γ-hémolytiques), bien que certaines souches puissent être bêta-hémolytiques sur gélose au sang de chevale.
Ils peuvent également se développer dans des conditions extrêmes telles que la présence de 6,5% de NaCl, 40% de sels biliaires et à un pH de 9,5. Ces conditions sont souvent utilisées comme aides au diagnostic.
La gélose bile-esculine-azide et la gélose CNA (Colistin Nalidixic Acid agar) sont des milieux de culture spécifiques qui favorisent la croissance des entérocoques tout en inhibant la croissance d'autres bactéries.
◉ 3- Identification du genre Enterococcus
- Oxydase négatif négatif.
- Test de catalase négatif: cela le distingue des genres catalase-positifs comme Staphylococcus et Micrococcus.
- Test PYR positif: La plupart des espèces du genre Enterococcus produisent de la pyrrolidonylarylamidase (PYR A).
- Croissance sur gélose bile-esculine avec hydrolyse à l'esculine.
- Détection de l'antigène D: les entérocoques possèdent l'antigène Lancefield du groupe D, lié aux acides lipotéichoïques présents dans la paroi cellulaire. Cependant, sa démonstration est incohérente et n'a plus d'intérêt à des fins d'identification.
◉ 4- Identification de l'espèce Enterococcus faecalis et caractéristique biochimique
L'identification des espèces d'entérocoques isolées d'infections graves est cruciale pour un traitement efficace et une surveillance épidémiologique.
La résistance au tellurite de potassium est une caractéristique clé pour l'identification rapide de Enterococcus faecalis. De plus, E. faecalis se caractérise par les éléments suivants:
- Mobilité: généralement immobile.
- Pigment jaune: négatif (-).
- Hydrolyse de l'arginine: positive (+).
- Utilisation du mannitol: positif (+).
- Utilisation du sorbitol: positif (+).
- Utilisation du raffinose: positif (+).
- Utilisation du saccharose: positive (+).
- Utilisation du sorbose: négatif (-).
- Test Voges-Proskauer (VP): Positif (+).
Pour une identification biochimique plus complète, des galeries biochimiques telles que Api 20 strep ou des automates d'identification bactériologique (MicroScan WalkAway plus System, ALFRED 60/AST.. ) peuvent être utilisées.
◉ 5- Profil de résistance aux antibiotiques
Le profil de résistance aux antibiotiques peut également aider à différencier les différentes espèces d'entérocoques:
- Les espèces d'Enterococcus faecium sont résistantes à l'ampicilline et très résistantes à l'imipénème.
- Les espèces d'Enterococcus faecalis sont naturellement résistantes aux lincosamides et à la streptogramine A et sensibles à l'imipénème.
- E. gallinarum et E. Les espèces casseliflavus ont des CMI de 4 à 32mg/l pour la vancomycine.
◉ Résistance
Enterococcus faecalis est connu pour sa capacité à résister à de nombreux antibiotiques, ce qui le rend plus difficile à traiter. Cette bactérie a la capacité de former des biofilms, qui sont des communautés bactériennes adhérant aux surfaces et protégées par une matrice de substances extracellulaires.
La formation de biofilm sert de protection contre les réponses immunitaires de l'hôte, rendant Enterococcus faecalis encore plus résistant aux antibiotiques et aux désinfectants.
◉ Résistance intrinsèque
Enterococcus faecalis est connu pour sa résistance intrinsèque à certains antibiotiques, notamment l'oxacilline, les pénicillines, les céphalosporines, monobactames, lincosamides et streptogramine A (phénotype LSA). De plus, il présente une faible sensibilité aux aminosides en raison du transport inefficace de ces antibiotiques à travers la membrane cytoplasmique.
◉ Résistance acquise
Enterococcus faecalis peut acquérir une résistance aux antibiotiques par divers mécanismes : production de pénicillinase, augmentation de l'expression de la PLP5 de faible affinité, altération de la cible moléculaire (résistance à la streptomycine), acquisition des gènes Van (A, B, D, E, G). Ces derniers sont responsables de résistance à des niveaux variables à la vancomycine et à la teicoplanine.
◉ Surveillance
La surveillance d'Enterococcus faecalis est importante pour surveiller la prévalence, l'incidence et les profils de résistance de cette bactérie, qui peut provoquer des infections dans diverses parties du corps, en particulier chez les patients hospitalisés.
Les méthodes de surveillance comprennent des tests en laboratoire, la déclaration et le suivi des isolats d'entérocoques, ainsi que des mesures de contrôle des infections, telles que l'hygiène des mains, le nettoyage de l'environnement et l'utilisation appropriée d'antibiotiques.
◉ Conclusion
En conclusion, Enterococcus faecalis est une bactérie qui nécessite une attention particulière et des investigations plus approfondies. En améliorant nos connaissances et en mettant en œuvre des stratégies globales, nous pouvons mieux lutter contre les défis posés par cet agent pathogène et améliorer les résultats pour les patients dans les établissements de soins de santé.